Hola Marva, lo primero que haria es quitar ese LOOP y tratar de realizar el SELECT a la MSEG con un FOR ALL ENTRIES, como dentro de la consulta participan el material, centro y lote, no habria problemas, xq dentro de la MSEG ya existe un indice por esos campos ....
Y tbm si se desea optimizar ese SELECT se puede realizar un JOIN con la MKPF y MSEG ya que ambas tablas son cabecera y detalle de los mismos documentos, espero te pueda ayudar
