En nuestra compañia solucionamos la facturacion haciendo una nota de cargo con referencia a la factura original.
Creabamos un item con price condition de Tax al 16 % en positivo y un item con el mismo valor pero con TAX al 15%
agrupamos en el layout ambos items y nos quedaba con subtotal cero, TAX 1 % y total por el 1 %
Los textos fueron modificados en la referencia para apegarse a los requisitos fiscales.
Una solucion manual pero permite que sea desde SD y que afecte correctamente contabilidad.