Hola,
entiendo que estas utilizando la misma clase de pedido de venta para las distintas org de venta.
quizá lo que puedas hacer es lo siguiente:
1- tabla z con: Clase de pedido-organiz ventas-clase de factura a asignar
2- en el control de copia de pedido a entrega poner un código para modificar el campo: LIKP-FKARV
Con esto debería ser suficiente
Saludos