Sinceramente no se bien el sentido amplio para el uso de "Call transformation" pero recuerdo haberlo usado por ejemplo para pasar los datos de una tabla interna a un archivo XML, para esto primero declaras la transformación con el formato que va a tener (por ejemplo los tags que tendrá el XML) y luego haces el call a esa transformation.
Te recomiento que visites el sdn de sap que hay info sobre esto que te comento.
Saludos,
Germán.