Hola,
no consigo enterarme muy bien de lo que se está tratando.
Yo interpreto que te has creado un almacén logístico nuevo ¿correcto?
¿Lo has creado como copia de otro que ya te funcionara? Es una cuestión bastante importante para que arrastre todos los datos del que ya funcionaba.
Yo interpreto que lleváis gestion de almacenes WM ¿correcto?
¿has tenido que crear un nuevo número de almacén para el almacén logístico? ¿lo creaste con copia a alguno que ya te funcionara? Es una cuestión bastante importante para que arrastre todos los datos del que ya funcionaba.

Me imagino que todo esto que estás contando lo estarás probando en una máquina de desarrollo y que no habrás pasado nada a la máquina de productivo ¿correcto?

Ahora bien, yo no estoy muy puesta en el tema de WM (soy más de la parte de SD, CS, PM) pero creo que te faltaría alguna entrada en la siguiente entrada de customizing:

Customizing --> Logistic Execution --> Gestión de almacenes --> Interfases --> Gestión de stocks --> Definir clase de movimiento

Espero haberte ayudado.

Marga.