Sandra la verdad que esta medio confuso tu problema.

Me comentas que tienes la misma moneda en la transacción, documento y sociedad, de ser asi deberías tener el mismo importe en las tres, caso contrario pueda que el problema este donde dices en la contabilización inicial.

En todo casdo si tu problema no es extremadamente urgente mandame un correo con las pantallas y el mensaje de error detallado y a ver como te puedo ayudar.

Saludos