Hola,
realiza el seguimiento del documento registrado y verifica en la pestaña WM si te genero orden de transporte o necesidad de trasporte, en caso de generarte orden de transporte verifica si esta confirmada de lo contrario la debes confirmar por la LT12, en caso de generarte numero necesidad de transporte debes crear la orden de transporte a partir de dicho numero de necesidad por la LT04 y confirmarla posteriormente, para que no te ocurra esto debes configurar la creación automatica de las ordenes de transporte.
Espero que te sirva de ayuda... ah y otra pon una carita feliz
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Saludos,
Estefany