Hola,
Entra en la transacción FEBAN, filtra por sociedad, banco y cuenta, busca el extracto que no se contabilizó (aparecerá en rojo al costado) marcas la linea y le das al icono de contabilizar, ahi podrás ver cual fue el problema; puede ser por no tener fechas abiertas para contabilizar, o que no ecuentre la partida, etc.
espero te sirva, un saludo...
