Hola, si estas contabilizando una factura en SD, fijate que tengas cargada la cuenta asociada en el maestro de clientes (XD02, Vista de Sociedad Solapa > Gestion de Cuenta > Campo Cuenta Asociada)
En el caso de que estes ingresando una factura de proveedor, fijate que el mismo tenga una cuenta asociada. Transacción FK02, Pasar a gestion de Cuentas, Campo cuenta Asociada.
Saludos! Espero haberte ayudado